LILO dispone di un command prompt che permette di eseguire operazioni più evolute della scelta del sistema operativo da caricare.
La possibilità di digitare i seguenti comandi può essere, per sicurezza, soggetta all'introduzione di una password.
TAB
Visualizza l'elenco delle label disponibili, cioè dei sistemi operativi e delle versioni del kernel selezionabili al boot.
linux rescue
Carica l'immagine con label linux in modalità single user mode (init 1) per interventi di amministrazione straordinaria sul sistema.
linux single
Come rescue, con la differenza che viene tentato il boot da disco.
root=/dev/...
Come nel file lilo.conf, definisce il dispositivo di boot permettendo di bootare, per esempio dal CDROM senza modificare il BIOS.
vga=80x25
Definisce la modalità video della console: colonne x righe.
Installazione e configurazione di LILO, GRUB e altri Linux loader
Linux e la sicurezza fisicaProblematiche di sicurezza su server fisicamente non protetti